Northern blotting umožňuje pozorovat formu exprese konkrétního genu mezi tkáněmi, orgány, vývojovými stádii, úrovněmi environmentálního stresu, patogenní infekce a v průběhu léčby. Tato technika byla použita k prokázání nadměrné exprese onkogenů a snížení regulace tumor-supresorových genů v rakovinných buňkách ve srovnání s "normální" tkání, navíc jako genová forma exprese při odmítnutí transplantovaných orgánů. Pokud je nadměrně regulovaný gen pozorován množstvím mRNA na northern blot, může být vzorek sekvenován, aby se určilo, zda je tento gen vědcům známý, nebo jde o nový nález. Forma expresních vzorů získaných za daných podmínek může poskytnout vhled do služby tohoto genu. Od RNA je nejprve oddělena velikostí, pokud je použit pouze jeden typ sondy, odchylka v úrovni každého proužku na membráně může poskytnout nahlédnutí do velikosti produktu, což naznačuje alternativní sestřihové produkty stejného genu nebo opakující se zřetězené motivy. Rozdíl ve velikosti genového produktu může navíc indikovat delece nebo chyby ve zpracování transkriptu. Změnou objektivu sondy použitého při známé zřetězení je možné určit, která oblast RNA chybí.
Obrázek 225A | Nastavení kapilárního blotting systému pro přenos RNA z electrophoresis gelu na blotting membránu. | RNA405 / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Capillary_blot_setup.svg) from Wikimedia Commons
Autor : Milos Pawlowski
Komentáře
Okomentovat