To je po ruce pomocí reverzibilních terminátorem vázaných dNTP v cyklické operaci, která zahrnuje inkorporaci nukleotidů, fluorescenční zobrazování a štěpení. Fluorescenčně značený terminátor je zobrazen, jakmile je každý dNTP přidán, a pak štěpen, aby umožnil začlenění další báze. Tyto nukleotidy jsou chemicky blokováno tak, že každé začlenění je jedinečnou událostí. Po každém kroku inkorporace báze následuje zobrazovací krok, poté je blokovaná skupina chemicky odstraněna za účelem přípravy každého řetězce pro další inkorporaci pomocí DNA polymeráza. Toto pořadí posloupnosti kroků pokračuje po určitý počet cyklů, jak je určeno uživatelem definovaným nastavením přístroje. 3 'blokující skupiny byly původně koncipovány jako enzymatické nebo chemické obrácení Chemická operace byla základem strojů Solexa a Illumina. Vyrovnání pomocí reverzibilní terminátorové chemie může být čtyřbarevný cyklus, jak ukazuje Illumina / Solexa, nebo jednobarevný cyklus, jak ukazuje společnost Helicos BioSciences.Helicos BioSciences používá "virtuální terminátory", což jsou odblokované terminátory s druhým analogem nukleosidů, který působí jako inhibitor. Tyto terminátory mají vhodné modifikace pro ukončení nebo inhibování skupin tak, že DNA syntéza je ukončena po přidání jedné báze.
Obrázek 155A | Technologie PacBio SMRT a Oxford Nanopore mohou použít nezměněné DNA, aby narazily na methylaci. | Nivretta Thatra / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:3rd_gen_Epigenetics.png) z Wikimedia Commons
Autor : Yavor Mendel
Komentáře
Okomentovat