Vztah k jiným technikám amplifikace

RPA je jednou z několika technik amplifikace nukleových kyselin, které mají být vyvinuty jako technika molekulární diagnostiky, často za účelem zjednodušení laboratorního vybavení vyžadovaného ve vztahu k PCR. Částečný seznam dalších izotermálních amplifikačních technik zahrnuje LAMP, NASBA, helikázovou závislou amplifikaci (HDA) a amplifikační reakci enzymu nicking (NEAR). Techniky se liší ve specifikách uspořádání primerů a reakčního mechanismu a v některých případech (jako RPA) využívají koktejly dvou nebo více enzymů. Stejně jako RPA, mnoho z těchto technik nabízí rychlé amplifikační časy s potenciálem pro zjednodušené vybavení a vykazovanou rezistenci vůči látkám v nepurifikovaných vzorcích, o nichž je známo, že inhibují PCR. S ohledem na dobu zesílení mohou moderní termocyklery s rychlými teplotními rampami zkrátit doby zesílení PCR na méně než 30 minut, zejména u krátkých amplikonů využívajících duální teplotní cykly místo konvenčních tří teplotních protokolů. Rovněž požadavky na přípravu vzorků (včetně lýzy a extrakce DNA nebo RNA, pokud je to nutné) by měly být považovány za součást typické doby a složitosti spojené s technikou. Tyto požadavky se liší v závislosti na technice navíc, pokud jde o konkrétní cíl a typ vzorku.

Obrázek 249A | Schematické znázornění molekulárního mechanismu použitého pro screening rekombinantních buněk Dylan2106 / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Blue_white_assay_Ecoli.jpg) from Wikimedia Commons

Obrázek 249A | Schematické znázornění molekulárního mechanismu použitého pro screening rekombinantních buněk Dylan2106 / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Blue_white_assay_Ecoli.jpg) from Wikimedia Commons

Autor : Milos Pawlowski

Reference:

Techniky molekulární biologie II

Nástroje molekulární biologie V

Komentáře