Dynamické genomy s vysokou plasticitou jsou nezbytné k tomu, aby patogeny, zejména bakterie, mohly přežít v měnícím se prostředí. S pomocí vysoce výkonných metod sekvenování a v technologiích silikonu je možné odhalit, porovnat a katalogizovat mnoho z těchto dynamických genomických událostí. Genomická rozmanitost je důležitá při detekci a léčbě patogenu, protože tyto události mohou změnit službu a složení patogenu. Abychom pochopili patogenní mechanismy, je třeba analyzovat více než jediné zřetězení genomu patogenního druhu. Srovnávací genomika je metodologie, která vědcům umožňuje porovnat genomy různých druhů a kmenů. Existuje několik příkladů úspěšných srovnávacích studií genomiky, mezi nimi i kontrola Listeria a Escherichia coli. Některé studie se pokusily řešit rozdíl mezi patogenními a nepatogenními mikroby. Toto šetření se však ukázalo jako obtížné, i když jediný bakteriální druh může mít mnoho kmenů a genomový obsah každého z těchto kmenů se liší.
Obrázek 383A | microarray čip obsahuje komplementární DNA (cDNA) pro mnoho sekvencí. CDNA fluoreskuje, když hybridizuje s odpovídajícím DNA fragmentem ve vzorku. | Národní onkologický ústav / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microarray_Comparative_Genomic_Hybridisation.jpg) z Wikimedia Commons
Autor : Merim Kumars
Reference:
Lékařská mikrobiologie II: Sterilizace, laboratorní diagnostika a imunitní reakce
Komentáře
Okomentovat