DNA generace kolonií (Bridge amplification)

Dopředné a zpětné primery jsou kovalentně připojeny k diapozitivu v průtokové komoře při vysoké hustotě. Poměr primerů k templátu na nosiči definuje povrchovou hustotu amplifikovaných shluků. Průtoková buňka je vystavena činidlům pro prodloužení na bázi polymerázy a aktivace nastává jako volný / distální konec ligovaného fragmentu "můstků" komplementárním oligo na povrchu. Opakovaná denaturace a rozšíření vede k lokalizované amplifikaci DNA fragmenty v milionech samostatných míst napříč povrchem průtokové buňky. Amplifikace v pevné fázi produkuje 100–200 miliónů prostorově oddělených templátových shluků, což poskytuje volné konce, ke kterým je poté hybridizován univerzální primer pro sekvenování, aby zahájil sekvenční reakci. Tato technologie byla podána v roce 1997 patentem od Glaxo-Welcome's Geneva Biomedical Research Institute (GBRI), Pascal Mayer, Eric Kawashima a Laurent Farinelli, a byla veřejně představena poprvé v roce 1998. V roce 1994 Adams a Kron podali patent na podobnou, ale neklonální operaci povrchového zesílení, pojmenovanou "přemostění můstku" přizpůsobené pro klonální zesílení v roce 1997 Churchem a Mitrou.

Obrázek 155A | Technologie PacBio SMRT a Oxford Nanopore mohou použít nezměněné DNA, aby narazily na methylaci. | Nivretta Thatra / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:3rd_gen_Epigenetics.png) z Wikimedia Commons

Obrázek 155A | Technologie PacBio SMRT a Oxford Nanopore mohou použít nezměněné DNA, aby narazily na methylaci. | Nivretta Thatra / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:3rd_gen_Epigenetics.png) z Wikimedia Commons

Autor : Yavor Mendel

Reference:

Techniky molekulární biologie I

Nástroje molekulární biologie III

Komentáře